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Old Lectures => 2011년 2학기 계산화학 => Topic started by: 황원석 on December 12, 2011, 09:41:03 AM



Title: 프로젝트 발표자료
Post by: 황원석 on December 12, 2011, 09:41:03 AM
조금 늦어졌습니다. 죄송..


Title: Re: 프로젝트 발표자료
Post by: 구자영 on December 14, 2011, 03:04:01 PM
생물학적으로 조금 이상한 점이 있는 것 같아 여쭤봅니다.
마지막 분석에서 보면,
일반적으로 His는 physiological condition에서 positive charge를 거의 띄지 않기에 (pKa~6)
positive amino acids로 넣는 것은 이상하지 않나 싶습니다.


Title: Re: 프로젝트 발표자료
Post by: 황원석 on December 14, 2011, 04:37:37 PM
안녕하세요.

생화학책을 찾아보니 말씀하신대로 His같은 경우 일반적인 physiological condition에서 positive charge를 갖지 않을 것 같네요.
사실, long-range columb interaction 말고도 helix 구조의 경우 DNA major groove와 크기가 비슷하다는 점에서 short-range interaction 도 DNA-protein
interaction에 영향을 주겠지만 좀 더 정량적 설명은 제가 이쪽 지식이 아직도 얇다보니 잘 말씀드리기 힘드네요.
지적 감사합니다.

황원석 드림


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